Основна дейност
Провеждат се изследвания в областта на хорологията, систематиката, таксономията, фитогеографията, екологията и физиологията на различни видове растения от България.
Текущи проекти
Проучване на флората и растителността на защитените местности Трескавец в Стара планина и Соколата в Малешевска планина
Изследвания върху флората и растителността на блатата при с. Долни Богров (Софийско) и защитените местности Дренето (при Ботевград) и Турченица при с. Локорско (Софийско)
Колекции
Във фондовете на музея се съхраняват около 1200 вида хербарни образци от флората на България, както и лишейната колекция на Божана Желязова, съдържаща около 5000 ексиката.